最大的一组哺乳动物基因组揭示了濒临灭绝的物种

一个国际研究团队进行了一项名为“动物学家项目”的研究，分析和比较了所有哺乳动物家族中超过80%的整个基因组，跨越了近1.1亿年的进化过程。包括120多个以前未被测序的物种的基因组，并以前所未有的规模捕获了哺乳动物的多样性。

该数据集旨在促进人类健康研究。研究人员可以利用这些数据比较人类和其他哺乳动物的基因组，这可能有助于确定可能与人类疾病有关的基因组区域。

“这个项目的核心想法是开发和利用这些数据来帮助人类遗传学家弄清楚哪些突变会导致疾病，”布罗德大学脊椎动物基因组学科学主任、乌普萨拉大学比较基因组学教授、共同资深作者Kerstin lindbladi - toh说。

然而，在分析新的基因组时，作者还发现，灭绝率高的哺乳动物物种遗传多样性更少。这些发现表明，即使只是对单个个体进行排序，也可以以一种成本效益的方式提供关键的信息，即哪些种群可能面临更高的灭绝风险，并且应该被优先考虑，以便深入评估保护需求。

“我们写这篇论文是为了谈论这个庞大而独特的数据集，并解释它为什么有趣。一旦你使数据广泛使用和解释其效用更广泛的研究社区,你可以真正改变科学的方式完成,”Karlsson说文章的第二作者埃丽诺,脊椎动物基因组学组主任麻省理工和哈佛大学和马萨诸塞大学医学院的教授。

在最近的一项研究中，动物学数据已经帮助研究人员评估了多种物种感染SARS-CoV-2的风险。研究人员发现了47种极有可能成为SARS-CoV-2病毒宿主或中间宿主的哺乳动物。

映射的哺乳动物

动物学项目，以前叫做200只哺乳动物项目，建立在之前的项目29只哺乳动物项目的基础上，该项目于2006年开始对哺乳动物基因组进行测序。最新的项目通过探索能够完成人类无法完成的生理壮举的物种的基因组，扩展了这项工作，从冬眠的松鼠到异常长寿的蝙蝠。该项目还包括濒危物种的基因组。

在这项新的研究中，研究人员与世界各地的28个不同机构合作，收集样本用于基因组分析，圣地亚哥全球动物园的冷冻动物园提供了近一半的样本。该团队关注于医学、生物和生物多样性保护方面的物种，并将具有代表性基因组的哺乳动物家族比例从49个增加到82个。

该项目还开发并分享了一些工具，这些工具将使研究人员能够查看哺乳动物基因组序列中的每一个“字母”或碱基，并将其与人类基因组中同等位置的序列进行比较，包括可能涉及疾病的区域。这可以帮助研究人员识别那些在进化过程中保持相同和功能的基因位点，以及那些随机突变的基因位点。如果一个地方在哺乳动物中保持了数百万年的稳定，那么它可能有一个重要的功能，所以这个地方的任何变化都可能与疾病有关。

在发布这些数据时，作者呼吁科学界支持实地研究人员收集样本，增加对计算资源的访问，使分析大量基因组数据集成为可能，并快速和公开地共享基因组数据。

最令人兴奋的事情之一是，我们的许多核心问题对科学界内外的人都是可触及的，”第一作者黛安·杰尼勒克斯(Diane Genereux)说，她是布罗德学院脊椎动物基因组学小组的研究科学家。“通过设计对所有人开放的科学项目，我们可以确保公共、人类和环境健康受益。”